Во время реставрационных работ в 1599 году, кардинал Паоло Эмилио Сфондати приказал открыть мраморный саркофаг ,в кипарисовом ящике были открыты мощи Святой Чечилии. Тело Святой сохранилось нетронутым тленом. Святая была в белом платье и со следами ранния на горле. Это событие было признано чудом. 

Скульптор Стефано Модерно видел это тело и воспроизвел в мраморе и позу Святой Чечилии в которой было найдено тело. Сейчас , спустя века, мы можем видеть в каком виде предстала Святая Чечилия перед изумленными римлянами  четыреста лет назад.  Скульптура находится сейчас в нише главного алтаря церкви.

Сесилия за приверженность христианству была приговорена к смерти и было помещена в горячее отделение бани ( калдариум). В течении трех дней девушка находилась в горячем отделении бани и осталась жива, поэтому ей перерезали горло на четвертый день , во время правления императора Марка Аврелия. Святая была упокоена в катакомбах Святого Калиста и ее могила была потеряна. Когда же начались поиски захоронения никто не мог найти это место. Когда уже отчаялись и прекратили поиски могилы, Святая явилась во сне папе Римскому и указала место захоронения. Утром тело было в том месте где указала Святая. Тело было перенесено в 821 г.н.э. в церковь Святой Чечилии. Где и покоится сейчас.